上海市胸科醫院（暨上海交通大學附屬胸科醫院），創建于1957年，為我國最早建立的集醫療、教學、科研為一體的，以診治心、肺、食管、氣管、縱隔疾病為主的三級甲等專科醫院，被衛生部指定為全國心胸外科進修基地，2004年成為上海市紅十字胸科醫院。醫院先后獲得“全國衛生系統先進集體”、“全國無煙單位”、“上海市職業道德建設十佳單位”、“上海市文明單位”八連冠等殊榮。
醫院設有10個臨床科室、13個臨床亞專科和10個醫技科室。核定床位580張，開放床位964張，病區22個，另設ICU和CCU。附設上海市胸部腫瘤研究所、中心實驗室、心血管研究室、生物樣本庫和國家藥物臨床試驗機構，并建有高新技術轉化園區。現有在職職工1342人，其中正副主任醫師184名，醫生隊伍中博士生121名，碩士生136名，博士生導師、碩士生導師58名，享受國務院特殊津貼32名。擁有國家衛生計生委有突出貢獻中青年專家、上海領軍人才、上海市優秀學科帶頭人、上海市人才發展基金、上海交通大學晨星計劃、上海青年醫師培養資助計劃等各類人才。
醫院面向全國收治門急診和住院病人逾70萬人次/年，年心胸手術數已超15000例，其中三、四級手術占比超90%，居全市最高。胸外手術量保持全市第一，胸外科機器人手術量及個人手術量居全國第一。目前醫院開展的單肺、雙肺、肺葉移植術，冠心搭橋術，心臟單、雙瓣膜置換術及瓣膜成形術，各種心臟復雜畸形的診治，各類肺、食管、氣管、縱隔手術，心胸外科微創手術、包括達芬奇機器人手術系統輔助下的心胸手術，各類心臟疾病的介入診治，惡性心律失常和急性心肌梗塞的救治，氣管鏡的診療技術以及病理細胞、組織學檢測等均居國內先進水平；射頻消融治療房顫的手術數量和質量為亞太地區之首；肺癌的早期診斷和多學科治療等居國際先進水平；還曾成功施行同種異體原位心臟移植術。
醫院擁有國家重點學科1個，國家臨床重點專科3個，國家中醫藥管理局“十二五”重點專科1個，上海市醫學重點學科，上海交通大學重點學科，上海市肺部腫瘤臨床醫學中心，首批國際認證胸痛中心，中國胸痛中心質量控制中心，首批中國胸痛中心、首批中國心衰中心、首批中國房顫中心，上海市首批癌痛示范病房，上海交通大學房顫診治中心，上海交通大學食管疾病診治中心。承擔著國家863攻關課題、國家自然科學基金、上海市自然科學基金、上海市科技創新行動計劃、上海市登山計劃等多項國家、部、市、局級課題的研究，獲得中華醫學科技獎、上海市科學技術獎、上海市醫學科技獎等獎項。并承擔衛生部冠脈介入、心律失常、結構性心臟病介入診療培訓基地、衛生部呼吸內鏡培訓基地、衛生部專科醫生培訓基地、上海市住院醫師規范化培訓外科基地（胸心外科方向）、上海市專科醫生培訓基地以及預防心臟性猝死上海培訓基地、上海市重癥監護護士實訓基地、中華醫學會麻醉學分會靶控輸注技術培訓中心等工作。憑借世界規模最大的胸外科中心實力，醫院開展規范、全面、系統的“國際臨床教育項目”（International Fellowship），并被亞洲胸腔鏡教育委員會（ATEP）授予中國大陸第一家也是唯一一家示范中心（Center ofExcellence）。已舉辦全國心胸外科進修班47期，每年承擔“肺癌多學科診斷治療”、“胸心外科學進展”等多項國家級繼續教育項目的培訓任務以及各高等院校的教學任務，并設有博士后流動站招生點。
